細胞STR分型檢測流程

首先了解下STR檢測流程，先提取細胞DNA, 然后進行PCR擴增及測序，最后進行結果分析。詳細檢測流程請看下圖：

▲圖1 STR檢測流程

Dr.Cell 采用的細胞STR鑒定方法完全符合美國國家標準局（NIST）頒布的細胞鑒定標準-ANSI/ATCC ASN-0002-2011, 并且在中國CMA認證與司法鑒定許可的實驗室進行檢測。

STR位點基因分型結果

完整的細胞STR檢測報告請查閱（STR Report-Sample），報告上會列出受檢細胞系STR基因分型結果附表（圖2），表格中將列出所有實際檢測位點信息。第2列“Sample”為樣本檢測得到的STR位點信息, 該結果是根據實際PCR擴增后檢測到的片段長度得到的數據信息。第3列為ATCC、DSMZ等數據庫中標準細胞STR位點信息。數據庫中常規提供9個位點信息，即 Amelogenin, CSF1PO, D13S317, D16S539, D5S818, D7S820, THO1, TPOX, vWA。

▲圖2 STR基因分型結果

STR位點基因分型結果峰圖

在報告中會給出受檢細胞系的STR檢測結果峰圖（圖3），該峰圖是實際PCR擴增后檢測到的片段長度和分型信息。位點信息與表1（圖2）相同。

▲圖3 STR基因分型結果峰圖

STR: 短串聯重復序列（short tandem repeats，STR）也稱微衛星DNA（microsatellite DNA）, 通常是基因組中由1~6個堿基單元組成的一段DNA重復序列，由于核心單位重復數目在個體間呈高度變異性并且數量豐富，構成了STR基因座的遺傳多態性。

    ▲圖4 STR 短串聯重復序列

純合子：Homozygote，指同源染色體在同一基因位點上的兩個等位基因相同。即顯示單個峰。

雜合子：Heterozygote，指同源染色體在同一基因位點上的兩個等位基因不相同。即顯示2個峰。

▲圖5 STR位點峰圖

人源正常組織細胞其STR圖譜，一個基因位點僅出現一個或2個峰（更多信息請查閱短串聯重復序列 (STR, short tandem repeats) ）。如發生細胞交叉污染現象，基因位點會出現多等位基因，即一個基因位點出現3或4個峰（圖6）。當然，也不能排除可能為三倍體等多倍體突變現象。

▲圖6 多等位基因峰圖

STR位點基因分型結果比對

根據鑒定得到的細胞STR位點信息在ATCC、DSMZ等數據庫中進行比對，進入ATCC STR數據庫頁面（https://www.atcc.org/en/STR_Database.aspx ）輸入檢測細胞的9個STR位點信息，與ATCC數據庫進行對比。

▲圖7 ATCC 數據庫比對

輸入信息后給出比對結果（圖8）

▲圖8 ATCC數據庫比對結果

同樣在DMSZ數據庫進行數據比對，得到匹配結果。

▲圖9 DSMZ數據庫比對結果

比對結果中"%Match"（ATCC, 圖8）及 "EV" （DSMZ, 圖9）列是受檢細胞的9個STR位點基因分型數據與數據庫中細胞的匹配度。

人源細胞STR鑒定結果判定標準：

1.根據國際細胞鑒定委員會(ICLAC)制定的細胞STR鑒定標準，細胞系的匹配度≥80% 時，認為它們具有相關性，即衍生于共同的祖先細胞；匹配度在55% 至 80% 之間，需要進一步驗證相關性；小于55%，表明兩者不具有相關性。
2.圖譜有效峰為真實的PCR條帶;小峰和非特異性條帶在計算中忽略不計。
3.本匹配度計算默認依照ATCC的計算規則，少數情況時依照DSMZ的計算規則，若有個性化需求委托方可提前提出。
4.委托方細胞樣本若為干細胞，免疫細胞，原代細胞等細胞，且未提交至公開數據庫，STR數據與數據庫比對無意義。
5.STR數據比對默認ATCC，DSMZ，JCRB等細胞庫，也可比對ECACC,COG,CBA,KCLB等數據庫或文獻，需提前注明被檢樣本的比對來源。
6.基因座分型只有一個數字，表示該基因座為純合子；基因座有兩個不同數字，表示該基因座為雜合子。